متن حكم رهبر معظم انقلاب به شرح زير است.
بسماللهالرحمنالرحيم
اعضاي محترم هيئت مؤسس دانشگاه آزاد اسلامي
با عنايت به فقدان تأثرانگيز رئيس محترم هيئت مؤسس و هيئت امناي دانشگاه و سكوت اساسنامه مصوب شوراي عالي انقلاب فرهنگي در چگونگي انتخاب رئيس هيئت مؤسس و ضرورت تسريع در انتخاب فرد عهدهدار اين مسئوليت، جناب آقاي دكتر علي اكبر ولايتي از اعضاي آن هيئت را بهعنوان رئيس هيئت مؤسس منصوب ميكنم تا هيچگونه وقفهاي در تمشيت قانوني امور آن دانشگاه - كه نقش مؤثري در امر آموزش عالي كشور دارد- بهوجود نيايد. همكاري اعضاي محترم هيئت مؤسس و هيئت امناي و شوراي عالي انقلاب فرهنگي در تكميل اعضاي هيئت مؤسس و هيئت امناي مورد انتظار جدّي اينجانب است.
سيد علي خامنهاي
۳۰ ديماه ۱۳۹۵